微藻通過光合作用,在地球生物圈的碳固定、初級生物量積累和能量轉(zhuǎn)化等方面發(fā)揮著重要作用。一些具有含油量高、生長速度快、抗逆性強等生理特征的微藻,具備規(guī)模生產(chǎn)生物柴油等可再生燃料的潛力。而目前使用的ITS等系統(tǒng)發(fā)育分子標記經(jīng)常無法準確區(qū)分與鑒定種內(nèi)不同藻株或?qū)賰?nèi)不同藻種。因此,開發(fā)高靈敏度和高可靠性的微藻系統(tǒng)發(fā)育分子標記具有重要意義。
近日,中國科學(xué)院青島生物能源與過程研究所功能基因組團隊博士研究生魏力、辛一等人以一類高含油的海水微藻微擬球藻(Nannochloropsis)為模式,通過對Nannochloropsis屬內(nèi)的6個已知藻種共7個藻株的葉綠體和線粒體基因組進行完整測序和精細比較,首次系統(tǒng)評價了微藻細胞器基因組上所有編碼和非編碼DNA片段作為潛在系統(tǒng)發(fā)育分子標記的性能,發(fā)現(xiàn)與現(xiàn)有分子標記相比,種質(zhì)區(qū)分和鑒定的靈敏度和可靠性均顯著提高的一系列新的系統(tǒng)發(fā)育分子標記。據(jù)此,提出了一種在微藻屬內(nèi)進行精確種質(zhì)鑒定的新策略(圖1)。該研究成果已在線發(fā)表于BMC Genomics。
上述研究由該團隊負責(zé)人徐健研究員主持,聯(lián)合美國亞利桑那州立大學(xué)胡強教授團隊和美國馬里蘭大學(xué)陳峰教授團隊共同完成,并得到了中科院創(chuàng)新團隊國際合作伙伴計劃和太陽能行動計劃的支持。
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