日前,中國水產(chǎn)科學(xué)研究院黃海水產(chǎn)研究所海藻研究團隊與中科院北京生命科學(xué)院等單位合作,成功解析了大型褐藻——海帶的基因組,闡述了其進化和適應(yīng)的分子機制,揭示了我國養(yǎng)殖海帶群體生物多樣性不足的現(xiàn)狀,為大型褐藻種質(zhì)資源研究和利用提供了新的數(shù)據(jù)和啟示。相關(guān)成果發(fā)布在《自然—通訊》雜志上。
大型褐藻是世界上最重要的海洋蔬菜和褐藻膠工業(yè)用海藻。其中海帶是褐藻中較為高等并具有初步組織分化的大型藻類。為深入解析褐藻的進化歷程和適應(yīng)機制,挖掘與利用褐藻重要功能基因,加快分子育種和生物多樣性保護的進程,黃海所發(fā)起并主持實施了大型褐藻基因組計劃。
該研究團隊獲得了海帶主要栽培品系的高質(zhì)量基因組組裝結(jié)果,覆蓋了全基因組序列的98.5%,共有18733個蛋白編碼基因。比較基因組學(xué)分析發(fā)現(xiàn),海帶基因組擴增主要源于基因家族的擴增。
研究人員還獲得了有代表性的7份養(yǎng)殖海帶和9份野生海帶的高覆蓋度基因組草圖,通過比較分析,在全基因組水平上全面解析了栽培和野生海帶種間遺傳變異。研究人員表示,盡管養(yǎng)殖海帶和野生海帶存在不同程度的基因交流,但中國養(yǎng)殖海帶主要來源于日本同一個地理群體,養(yǎng)殖品系已經(jīng)呈現(xiàn)明顯退化狀態(tài)。
該論文闡釋了首例大型褐藻泛基因組研究成果,為研究海帶的遺傳多樣性及進化歷程提供了范例;同時,為海帶種質(zhì)資源的保護、開發(fā)、利用,拓寬海帶育成品種遺傳基礎(chǔ),推進海帶新品種培育進程提供了信息資源。