Trends in Plant Science：植物如何通過根系分泌物喂養(yǎng)根部菌群？
植物的根系分泌物可由植物根尖邊緣細(xì)胞、植物內(nèi)生菌分泌其代謝產(chǎn)物并轉(zhuǎn)運(yùn)至植物根圍，也可由植物根圍菌群分泌其代謝產(chǎn)物并轉(zhuǎn)運(yùn)至植物根內(nèi)；② 根系分泌物中含有糖類、磷酸糖類、氨基酸、有機(jī)酸、核苷酸、脂肪酸、無機(jī)物、次級(jí)代謝產(chǎn)物、激素等，分別通過不同的轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白家族運(yùn)輸；③ 植物將糖類、有機(jī)酸、脂質(zhì)傳遞給根部菌群，菌群將磷、氮及其它營養(yǎng)元素傳遞給植物；④ 與植物與菌群之間的營養(yǎng)及信號(hào)分子運(yùn)輸相關(guān)的轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白有待進(jìn)一步研究。
Nature Methods：如何全面、客觀地評(píng)估宏基因組分析方法？
宏基因組解析的批判性評(píng)估（CAMI）旨在全面、客觀地評(píng)估宏基因組分析方法，通過社會(huì)團(tuán)體參與標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)集、評(píng)估流程、性能標(biāo)準(zhǔn)的選擇以及聚集的問題的設(shè)計(jì)而建立標(biāo)準(zhǔn)；② CAMI以來自近700個(gè)新測(cè)序的微生物和近600個(gè)新病毒、質(zhì)粒的高度復(fù)雜真實(shí)數(shù)據(jù)集為基準(zhǔn)；③ 基因組組裝和聚類在檢測(cè)個(gè)體化基因組時(shí)性能良好，但易受其它相關(guān)菌株的影響；④ 分類分析和聚類在高分類級(jí)別上表現(xiàn)良好，科以下水平性能下降，參數(shù)設(shè)置明顯影響性能。
Food Hydrocolloids：體外培養(yǎng)環(huán)境粘性不同，長(zhǎng)的腸道細(xì)菌不同
胃腸模擬器的四個(gè)隔室內(nèi)充滿腸道營養(yǎng)培養(yǎng)基（GNM），添加不同濃度的瓊脂（0、0.30、0.45和0.60%），在0、24和48小時(shí)三個(gè)時(shí)間點(diǎn)收集樣本；② 隨著時(shí)間的推移，GNM瓊脂與糞便菌群孵育改變培養(yǎng)基粘性，甚至包括溫度和pH值恒定的條件下；③ 瓊脂為0時(shí)粘性隨時(shí)間輕度增加，瓊脂濃度增加時(shí)粘性隨時(shí)間下降；④ 粘性增加有利于厭氧菌和梭狀芽孢桿菌生長(zhǎng)，需氧菌和腸球菌屬的生長(zhǎng)則與粘性負(fù)相關(guān)；⑤ 腸道粘性選擇性修飾菌群組成，食物粘性影響胃腸系統(tǒng)。
Critical Reviews in Food Science and Nutrition：包裹益生菌，用乳脂球膜糖蛋白靠譜么？
包裹乳脂肪球的乳脂球膜糖蛋白（MFGM），其營養(yǎng)價(jià)值和工藝特性已得到驗(yàn)證；② MFGM為三層結(jié)構(gòu)，由磷脂、神經(jīng)鞘磷脂、膜特異性蛋白質(zhì)（主要為糖蛋白）等組成，有多種實(shí)驗(yàn)室和工業(yè)純化、分離方法；③ MFGM具有抗癌、參與DNA修復(fù)、抗菌、抗病毒、抗粘附作用；④ MFGM為自然的乳化劑，可穩(wěn)定牛奶中的脂肪球；⑤ 采用MFGM來源的磷脂包被生物活性物質(zhì)，可用于保健品和藥物的保護(hù)和釋放；⑥ MFGM糖蛋白可用于乳酸菌包被，其缺點(diǎn)在于形成的脂質(zhì)體太小。
Frontiers in Microbiology：處理廢棄活性污泥的厭氧分解池中的主要發(fā)酵細(xì)菌
厭氧分解中將有機(jī)物轉(zhuǎn)換成甲烷需經(jīng)過水解、發(fā)酵、脫氫和甲烷生成四個(gè)復(fù)雜微生物代謝過程；① 處理剩余污泥的中溫厭氧分解系統(tǒng)中，只能用16S基因測(cè)序分析綠彎菌門中不可培養(yǎng)的A6種系型里豐度最高的菌屬；② 對(duì)代表性A6分類群完整環(huán)狀基因組的注釋，提示其主要為化能有機(jī)異養(yǎng)型厭氧發(fā)酵細(xì)菌；③ 熒光原位雜交探針顯示A6形態(tài)為具有短絲蛋白的絮體，有時(shí)與甲烷絲菌屬共存；④ 根據(jù)基因組和形態(tài)將其命名為Brevefilum fermentans?gen. nov. sp. nov。
Frontiers in Microbiology：束毛藻屬聚集體中的菌群
束毛藻屬聚集體由束毛藻屬中的某些進(jìn)化枝及其表面寄生的微生物組成，分析束毛藻屬聚集體相關(guān)微生物組的多樣性及功能；① 最優(yōu)勢(shì)種為束毛藻屬類群I（鐵氏束毛藻），表面寄生菌群以擬桿菌門、α及γ變形菌綱為主導(dǎo)；② 束毛藻屬為帶有III型nifH（編碼固氮酶）序列類群的III型固氮菌的棲息地；③ 表面菌群大多營富營養(yǎng)的生活方式，與磷、鐵及脫氮途徑相關(guān)的基因含量豐富；④ 束毛藻屬聚集體上的微生物群落影響其在浮游環(huán)境中的地球生物化學(xué)功能。
Nature：IL-22如何促進(jìn)腸道上皮再生？
利用體外類器官培養(yǎng)，發(fā)現(xiàn)在腸道受損后，3型天然淋巴細(xì)胞（ILC）可產(chǎn)生IL-22促進(jìn)小鼠小腸類器官生長(zhǎng)；② 重組IL-22可直接靶向腸道干細(xì)胞（ISC），促進(jìn)小鼠及人的腸道類器官生長(zhǎng)及ISC的增殖；③ 在Lgr5+ ISC中，IL-22誘導(dǎo)STAT3的磷酸化，后者對(duì)于類器官形成及IL-22介導(dǎo)的腸道上皮再生十分關(guān)鍵；④ 小鼠接受骨髓移植后經(jīng)IL-22處理，可增強(qiáng)ISC的恢復(fù)，增加上皮再生，減少腸道病理及移植物抗宿主病。
Nature：3型天然淋巴細(xì)胞促進(jìn)腸道修復(fù)
① Lindemans等人發(fā)現(xiàn)，3型天然淋巴細(xì)胞（ILC3）能調(diào)控腸道干細(xì)胞（ISC）的活性，促進(jìn)受損的腸道上皮再生；② 體外培養(yǎng)腸道上皮類器官的實(shí)驗(yàn)表明，腸道上皮受損后，位于腸道隱窩下面的ILC3被激活并分泌IL-22，直接作用于ISC，觸發(fā)ISC內(nèi)的STAT3磷酸化，通過刺激ISC增殖來修復(fù)腸道上皮；③ 用IL-22治療患有移植物抗宿主疾?。℅vHD）的小鼠，可促進(jìn)ISC的恢復(fù)和腸道上皮細(xì)胞的再生；④ 該發(fā)現(xiàn)可能有助于臨床上緩解由骨髓移植導(dǎo)致的GvHD。
