植物生物學家對特別有希望的綠藻種類的基因組進行了測序,為生產可持續(xù)生物燃料,抗氧化劑和其他有價值的生物產品的新發(fā)現(xiàn)提供了藍圖。
綠藻基因組的測序提供了推進清潔能源生物產品的藍圖
研究人員將Chromochloris zofingiensis作為一種單細胞綠藻,作為生物燃料生產中最佳脂質生產商之一,已引起商業(yè)興趣。
由能源部(DOE)勞倫斯伯克利國家實驗室(伯克利實驗室)的研究人員與加州大學洛杉磯分校合作領導的科學家團隊最近在“美國國家科學院院刊”上發(fā)表了他們的研究成果。
這項工作是由霍華德休斯醫(yī)學研究所的教師科學家和研究員Krishna Niyogi在伯克利實驗室構思和開發(fā)的。
“該基因組將成為開發(fā)可再生和可持續(xù)微藻生物燃料以促進清潔能源和更清潔環(huán)境的重要資源,”研究的主要作者,Niyogi實驗室的博士后研究員Melissa Roth說?!霸孱愇斩趸?,并且通過光合作用固有太陽能,但是C. zofingiensis的另一個好處是它可以在非耕地和廢水中種植?!?/span>
Niyogi還指出,C。zofingiensis是蝦青素的天然來源,蝦青素是一種源自膳食藻類的抗氧化劑,可使鮭魚呈現(xiàn)粉紅色。在藻類中,蝦青素被認為可以提供免受氧化應激的保護。
“這種海藻有潛力作為保健品,”Niyogi說,他也是加州大學伯克利分校的植物和微生物生物學教授。“目前正在進行研究,以確定蝦青素的抗炎特性是否有益于治療癌癥,心血管疾病,神經退行性疾病,糖尿病和其他人類健康問題?!?/span>
為了深入研究細胞,研究人員依靠國家X射線斷層掃描中心(NCXT),這是一個位于實驗室高級光源的伯克利實驗室 – UCSF聯(lián)合項目。使用軟X射線斷層掃描技術,這種技術可與計算機斷層掃描相媲美,科學家對藻類基因組的部分進行成像,然后重建,以生成三維視圖。捕獲細胞分成兩個,四個甚至十六個子細胞。
“結合多種測序技術,我們能夠產生基因組的染色體水平組裝,這是一種非常高水平的藻類結構,與模式生物相似。事實上,C。zofingiensis的質量基因組可以媲美模型綠藻Chlamydomonas reinhardtii,這是大約十年前的第一次測序,“羅斯說。
藻類含有大約15,000個基因。