光合細(xì)菌可有效防止細(xì)菌、真菌感染和降解有害污染物，能防治動(dòng)物的病蟲(chóng)害和瓜果類(lèi)腐敗及老化，延長(zhǎng)貯藏期。光合細(xì)菌加入金魚(yú)的飼料中，成活率提高50%以上，加入對(duì)蝦池中發(fā)病率減少，對(duì)蝦苗生長(zhǎng)正常，色澤好。用光合細(xì)菌喂雞,有增加肉用仔雞免疫功能的作用。當(dāng)受到病原體（IBV）感染時(shí)，雞的抗體水平提高，發(fā)病減輕，雞體健康恢復(fù)較快，Y-球蛋白明顯升高。
光合細(xì)菌可作為果蔬保鮮劑，能抑制病菌引起的病害，對(duì)密桔和西瓜等的保藏有良好的作用,光合細(xì)菌防止病害的主要原因是因?yàn)樗哂袣⒕饔?能抑制其他有害菌群及病毒的生長(zhǎng)；同時(shí)可防治魚(yú)蝦疾病，如鯉魚(yú)的鰓腐病，穿孔病、蝦的紅腿病，黑鰓病，并能激活機(jī)體的免疫系統(tǒng)，提高動(dòng)物的免疫能力。
