在做藻類菌類實(shí)驗(yàn)的時(shí)候最繁瑣就是進(jìn)行生物量的計(jì)數(shù),沒有現(xiàn)成的自動(dòng)化工具,上海光語(yǔ)生物科技有限公司的工程師在網(wǎng)上發(fā)現(xiàn)一種不錯(cuò)的生物量細(xì)胞計(jì)數(shù)的方法,在這里和大家一起分享,盡量減少人工時(shí)間,提高效率,采用數(shù)碼相機(jī)和photoshop這2個(gè)工具。
由于網(wǎng)上的資料是采用瓜子的,所以我們直接以瓜子計(jì)數(shù)作為類推對(duì)象。出自知乎網(wǎng)站
1、將瓜子撒在淺色地面或淺色紙上,使其盡量分散開來;(藻細(xì)胞可以調(diào)整顯微鏡背景的光照度來實(shí)現(xiàn))
2、數(shù)碼相機(jī)拍照拷入電腦并用PS打開。若對(duì)比度不高可調(diào)節(jié)“閾值”;
3、選擇魔棒工具 > 點(diǎn)擊空白處 > 反向,得到所有瓜子的選區(qū)。若圖片中含有少量雜質(zhì)或接觸在一起的瓜子,可通過“選擇 > 修改 > 收縮”進(jìn)行去除或分離;
4、選擇“圖像>分析 > 選擇數(shù)據(jù)點(diǎn) > 自定”。在選區(qū)中,選擇“計(jì)數(shù)”并單擊“確定”;
5、選擇“窗口 > 測(cè)量記錄”;
6、選擇“分析 > 記錄測(cè)量”;
7、結(jié)果如下:
注:圖像處理過程可通過 “動(dòng)作” 功能實(shí)現(xiàn)自動(dòng)批處理以提高效率。