在做藻類菌類實驗的時候最繁瑣就是進行生物量的計數(shù),沒有現(xiàn)成的自動化工具,上海光語生物科技有限公司的工程師在網(wǎng)上發(fā)現(xiàn)一種不錯的生物量細胞計數(shù)的方法,在這里和大家一起分享,盡量減少人工時間,提高效率,采用數(shù)碼相機和photoshop這2個工具。
由于網(wǎng)上的資料是采用瓜子的,所以我們直接以瓜子計數(shù)作為類推對象。出自知乎網(wǎng)站
1、將瓜子撒在淺色地面或淺色紙上,使其盡量分散開來;(藻細胞可以調整顯微鏡背景的光照度來實現(xiàn))
2、數(shù)碼相機拍照拷入電腦并用PS打開。若對比度不高可調節(jié)“閾值”;
3、選擇魔棒工具 > 點擊空白處 > 反向,得到所有瓜子的選區(qū)。若圖片中含有少量雜質或接觸在一起的瓜子,可通過“選擇 > 修改 > 收縮”進行去除或分離;
4、選擇“圖像>分析 > 選擇數(shù)據(jù)點 > 自定”。在選區(qū)中,選擇“計數(shù)”并單擊“確定”;
5、選擇“窗口 > 測量記錄”;
6、選擇“分析 > 記錄測量”;
7、結果如下:
注:圖像處理過程可通過 “動作” 功能實現(xiàn)自動批處理以提高效率。