研究人員揭示工業(yè)微藻應(yīng)激產(chǎn)油的蛋白質(zhì)組動態(tài)規(guī)律
工業(yè)產(chǎn)油微藻在缺氮脅迫下能大量合成油脂,這一應(yīng)激反應(yīng)是微藻能源的科學(xué)基礎(chǔ)之一。近日,中國科學(xué)院青島生物能源與過程研究所單細(xì)胞中心針對微擬球藻,構(gòu)筑了缺氮脅迫下蛋白質(zhì)組動態(tài)模型,揭示了該應(yīng)激過程的三個生理階段,為油脂代謝工程提供了新視角。研究成果發(fā)表于《生物燃料技術(shù)》(Biotechnology for Biofuels)。
工業(yè)產(chǎn)油微藻在氮脅迫下的油脂積累過程,一直受到學(xué)界與工業(yè)界的密切關(guān)注。前期青島能源所單細(xì)胞中心基于轉(zhuǎn)錄組和代謝物組構(gòu)建了其機(jī)制模型(Plant Cell,2014,DOI:10.1105/tpc.113.121418),然而,轉(zhuǎn)錄組層面和代謝物組層面的實驗數(shù)據(jù)存在著重要差異,無法完全用基因表達(dá)到代謝調(diào)控之間的延遲解釋。這是由于從轉(zhuǎn)錄到代謝物變化的過程中仍受到蛋白質(zhì)層面的調(diào)控作用。
針對這一問題,研究人員發(fā)表了微擬球藻缺氮脅迫下時間系列的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù),結(jié)合相對應(yīng)的轉(zhuǎn)錄組與代謝組數(shù)據(jù),應(yīng)用最新的統(tǒng)計分析方法,較為全面地揭示了細(xì)胞在缺氮脅迫下合成甘油三酯的過程特征。研究人員發(fā)現(xiàn),該過程可以分為三個階段。缺氮初期:此時細(xì)胞感受到了外界環(huán)境中氮元素的缺乏,但由于細(xì)胞內(nèi)還有一定量的氮儲備,其代謝過程的變化不明顯。缺氮中期:這一階段細(xì)胞保存的氮已大致消耗完,需要通過蛋白質(zhì)降解等方式來回收氨基酸中的氮,以維持細(xì)胞關(guān)鍵代謝過程的運(yùn)轉(zhuǎn),同時光合作用與脂質(zhì)代謝等過程也受到了不同程度的影響。缺氮后期:細(xì)胞進(jìn)一步提高蛋白質(zhì)降解的速率,而三羧酸循環(huán)與油脂合成的速率大幅上調(diào),光合作用速率雖有所下降但仍在工作。
這一修正后的模型更加精確地刻畫了缺氮產(chǎn)油過程,并進(jìn)一步證明甘油三酯從頭合成對油脂積累起著主導(dǎo)作用,而膜脂回收僅占脂質(zhì)積累的一小部分。該模型為定向調(diào)控微藻代謝調(diào)控網(wǎng)絡(luò)以提升油脂產(chǎn)率提供了一系列新的策略與目標(biāo)。
該研究由德國魯爾大學(xué)植物生物化學(xué)系和青島能源所單細(xì)胞中心合作完成,得到了中科院含碳?xì)怏w生物轉(zhuǎn)化項目、基金委中德中心等的支持。
工業(yè)微藻應(yīng)激產(chǎn)油的蛋白質(zhì)組動態(tài)規(guī)律